Studi Docking Senyawa dalam Jeruk Pahit (Citrus aurantium) dan Adas Bintang (Anisi stellati) terhadap Sitokrom P450 51 (CYP51) Mycobacterium tuberculosis Menggunakan PyRx-vina

Abstract

Tuberkulosis (TB) merupakan penyebab kematian kesembilan di
seluruh dunia. Ekstrak jeruk pahit memiliki efek antibakteri tinggi, dan
minyak esensial neroli dari ekstrak bunga jeruk pahit memiliki
aktivitas anti-mikroba. Sama halnya dengan adas bintang yang juga
memiliki aktivitas anti-bakteri,dan anti-jamur. Enzim CYP51B1 (
homolog jamur sterol 14?-demethylase) dari M. tuberculosis
merupakan target pengobatan tuberkulosis dengan mekanisme antijamur.
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui gambaran mengenai
interaksi antara CYP51 dengan senyawa dalam kedua tanaman.
Docking molekular kandungan senyawa dalam kedua tanaman telah
selesai dilakukan dengan menggunakan PyRx-vina didukung dengan
PyMOL dan PLIP (Protein Ligand Interaction Profiler) untuk
membuat profil visual interaksi ligan-protein.Terapan dari docking
molekuler yaitu akan mempercepat proses penemuan obat dengan
melakukan penyaringan awal yang sangat cepat terhadap senyawasenyawa
kimia tertentu, terutama yang belum diketahui aktivitasnya
dalam tanaman tradisional. Binding affinity senyawa mairin dan
honokiol (adas bintang) dengan target protein 2w0a dan 2w09 adalah
-8,5 dan -8,9 kkal/mol, sedangkan untuk senyawa hesperidin dan
limonin (jeruk pahit) secara urut untuk kedua protein target adalah -
8.6 dan -9,0 kkal/mol. Interaksi ligan-protein melibatkan residu GLN-
72 dan LEU-321. Hasil docking menunjukkan nilai binding affinity
senyawa dalam kedua tanaman lebih baik dari ligan native, sehingga
diprediksi memiliki potensi inhibisi pada CYP51B1.