Prediksi Ikatan Molekular Kemenyan Jawa dan Adas Bintang terhadap Mutase Korismat Mycobacterium tuberculosis (2fp2, 3st6)
Keywords:
PyRx-vina, kemenyan jawa, adas bintang, mutase korismat, Myobacterium tuberculosisAbstract
Tuberkulosis merupakan masalah utama kesehatan di seluruh dunia.
Munculnya TB yang resisten terhadap multidrug 55 (TB-MDR) dan
obat (XDR-TB) mendorong pengembangan obat baru. Hal ini
merupakan salah satu cara penting untuk mengendalikan tuberkulosis.
Penelitian ini mengkaji interaksi senyawa dalam kemenyan jawa dan
adas bintang dengan protein Mutase Korismat (MTB-CM) melalui
docking molekular. Data tersebut diolah dengan metode molecular
docking dengan menggunakan program Pyrx-Autodock-Vina didukung
dengan PyMOL dan PLIP (Protein Ligand Interaction Profiler) untuk
membuat profil visual interaksi ligan-protein.. hasil docking
menunjukkan kemenyan jawa mempunyai binding affinity dengan
target protein 2fp2 dan 3st6 -7.5 dan -9.1 sedangkan kemenyan jawa -
7.3 dan -8.8.
References
Guedes I.A., de Magalhães C.S., Dardenne L.E., (2014). Receptor-ligand molecular docking.
Biophysical Reviews 6: 75-87.
Lechartier B., Rybniker J., Zumla A., Cole S.T. (2014). Tuberculosis drug discovery in the postpost-
367 genomic era. EMBO Mol Med. 158-68.
Misra, P. and Pal, M. (2017) ‘Mycobacterium tuberculosis chorismate mutase: A potential target
for TB’, Bioorganic & Medicinal Chemistry. doi: 10.1016/j.bmc.2017.02.001.
Mohamed, A., Nguyen, C. H. and Mamitsuka, H. (2015) ‘Current status and prospects of
computational resources for natural product dereplication : a review’, (4), pp. 1–13.
Rohs R., Bloch I., Sklenar H., Shakked Z (2005). Molecular flexibility in ab-initio drug
docking to DNA: binding-site and binding-mode transitions in all-atom Monte Carlo
simulations. Nucl Acids Res 33: 7048-7057.
Downloads
Published
How to Cite
Issue
Section
License
Copyright (c) 2018 Rani Wulandari, Broto Santoso
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
